ミサキは銀河中の学園に伝わる伝説のスケ番。宇宙少年院に幽閉されていたが、ダース番長の地球侵攻を阻止する任務を受ける事で共和国元老院議員の恩赦により、仮釈放される。早速ミサキは地球の漆が丘学園に潜入し初代番長の桜万次郎の協力でダース番長の居場所を突き止めるが、不審者として捕まり責められてしまう。しかし危機一髪の所で学園の反乱分子に救出され、ついに宿敵ダース番長と対決する事に！